HTSlib CRAM reader has out-of-bounds read due to improper validation of input
HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. As one method of removing redundant data, CRAM uses reference-based compression so that instead of storing the full sequence for each alignment record it stores a location in an external reference sequence along with a list of differences to the reference at that location as a sequence of "features". When decoding CRAM records, the reference data is stored in a char array, and parts matching the alignment record sequence are copied over as necessary. Due to insufficient validation of the feature data series, it was possible to make the `cram_decode_seq()` function copy data from either before the start, or after the end of the stored reference either into the buffer used to store the output sequence for the cram record, or into the buffer used to build the SAM `MD` tag. This allowed arbitrary data to be leaked to the calling function. This bug may allow information about program state to be leaked. It may also cause a program crash through an attempt to access invalid memory. Versions 1.23.1, 1.22.2 and 1.21.1 include fixes for this issue. There is no workaround for this issue.
- Опубликовано
- 18 мар. 2026 г.
- Обновлено
- 17 июн. 2026 г.
- EPSS
- 0,7 % · 50-й процентиль
- CWE
- CWE-125
Войдите, чтобы следить · Вы получите уведомление, если запись попадёт в KEV, получит эксплойт или обновится.
Инструменты для отчёта
Оценка срочности
27
Наблюдать
Пока низкий приоритет.
- CVSS
- 27 / 40 · 6.9 / 10
- CISA KEV
- 0 / 30 · Нет в списке
- EPSS
- 0 / 30 · 0,7 %
Решение CISA SSVC
- Эксплуатация
- нет
- Автоматизируемо
- да
- Техническое влияние
- частичное
Vulnrichment: входные данные дерева решений CISA.
Оценка CNA и NVD
- NVD
- —
- CNA · GitHub_M
- 6,9
- NVD ещё не выставил свою оценку; показана оценка CNA.
CVSS:4.0/AV:N/AC:L/AT:N/PR:N/UI:N/VC:L/VI:N/VA:L/SC:N/SI:N/SA:N
Оценка присваивающего органа и независимая оценка NVD. Разрыв означает, что критичность спорна.
Анализ Noroxi
Анализа Noroxi для этой записи пока нет
Мы не пишем анализ вручную для сотен тысяч уязвимостей в базе; это было бы нечестно. Для значимых уязвимостей с реальным влиянием наша команда описывает механизм, обнаружение и устранение.
Мы используем этот продукт, нужна помощьЗатронутые системы
| Вендор | Продукт | CPE |
|---|---|---|
| htslib | htslib | cpe:2.3:a:htslib:htslib |
Затронутые версии
Диапазоны версий NVD (для продуктов из каталога). Добавьте продукт в стек с версией, и сопоставление будет по ним.
- htslib htslibдо 1.21.1
- htslib htslib1.22 и новее · до 1.22.2
- htslib htslib1.23
Версии, заявленные вендором
Диапазоны затронутых версий, заявленные назначающей организацией (GitHub_M). Не зависят от анализа CPE в NVD и обычно опережают его.
samtools htslib
- < 1.21.1, >= 1.22, < 1.22.2, = 1.23затронута
Затронутые пакеты
Данные OSV и GitHub Advisory: экосистема, пакет и диапазон. Сопоставление SBOM использует эту таблицу.
| Экосистема | Пакет | Затронутый диапазон | Исправление |
|---|---|---|---|
| Debian:12 | htslib | все версии | — |
Тот же продукт
htslib: все записиДругие записи с наивысшей оценкой для того же основного продукта.
- CVE-2017-1000206samtools htslib library version 1.4.0 and earlier is vulnerable to buffer overflow in the CRAM rANS codec resulting in potential arbitrary c40В плане
- CVE-2018-13845An issue has been found in HTSlib 1.8.39Наблюдать
- CVE-2026-31968HTSlib CRAM decoder vulnerable to buffer overflow35Наблюдать
- CVE-2026-31963HTSlib CRAM reader has heap buffer overflow due to improper validation of input35Наблюдать
- CVE-2026-31962HTSlib CRAM reader has heap buffer overflow due to improper validation of input35Наблюдать
- CVE-2020-36403HTSlib through 1.10.2 allows out-of-bounds write access in vcf_parse_format (called from vcf_parse and vcf_read).35Наблюдать
Исправление
На какую версию обновиться
Версии с исправлением по данным вендора, реестров пакетов и Microsoft. Перед обновлением сверьтесь с бюллетенем вендора.
Для этой записи не зафиксирована версия с исправлением. Смотрите бюллетени вендора в источниках.
Статус эксплойта
Публичный эксплойт неизвестен
Публичный эксплойт пока не обнаружен. Это не значит, что вы в безопасности, лишь что порог чуть выше.
Контекст для исследователя
Для пентестеров и исследователей: профиль атаки, расхождение оценок, хронология, коммиты исправлений, авторы, кандидаты в варианты и цепочки, охват bug bounty. Всё выводится из имеющихся данных; без кода эксплойтов.
Хронология
От публикации до сегодня: proof of concept, модуль Metasploit, CISA KEV и запись об исправлении. Даты — как сообщают источники.
Кроме публикации датированных событий нет.
Ежедневная оценка FIRST EPSS; записываются только изменения от 0,01 (ступенчатый график).
Ссылки на патчи и коммиты
Коммиты, PR и diff среди источников. Отправная точка для patch-diff и поиска вариантов; это исправления, не эксплойты.
Авторы
Все исследователиНашедшие, сообщившие и аналитики, названные в записи CNA. Нажмите имя, чтобы увидеть другие записи исследователя.
В записи CNA нет авторов.
Кандидаты в варианты
Тот же продукт, тот же класс уязвимости, в пределах 18 месяцев. Если патч не закрыл первопричину, родственная ошибка здесь.
- CVE-2026-31965с разницей 0 дн.HTSlib CRAM reader has out-of-bounds reads due to improper validation of input27Наблюдать
- CVE-2026-31967с разницей 0 дн.HTSlib CRAM reader has out-of-bounds read due to improper validation of input27Наблюдать
Кандидаты в цепочки
Обход аутентификации и уязвимость, требующая привилегий, в одном продукте и близко по времени: вместе они могут дать путь без аутентификации.
—
Охват bug bounty
Известной публичной программы нет.
Источник: bounty-targets-data (публичные списки HackerOne, Bugcrowd, Intigriti, YesWeHack).
Технические детали
Условия атаки
- Может быть вызвана любым, у кого есть доступ через интернет.
- Учётная запись или пароль не требуются.
- Действия пользователя не требуются.
- Особые условия не требуются; воспроизводится стабильно.
В случае успеха
- Конфиденциальность
- Целостность
- Доступность
- Вектор атаки
- Сеть
- Сложность атаки
- Низкая
- Требуемые привилегии
- Не требуются
- Взаимодействие с пользователем
- Не требуется
- Область действия
- X
Класс уязвимости (CWE)
CWE-125 · Out-of-bounds ReadВектор CVSS
CVSS:4.0/AV:N/AC:L/AT:N/PR:N/UI:N/VC:L/VI:N/VA:L/SC:N/SI:N/SA:N/E:X/CR:X/IR:X/AR:X/MAV:X/MAC:X/MAT:X/MPR:X/MUI:X/MVC:X/MVI:X/MVA:X/MSC:X/MSI:X/MSA:X/S:X/AU:X/R:X/V:X/RE:X/U:X
nvd-secondary
Контекст атаки
Шаблоны атак MITRE CAPEC и техники ATT&CK для этого класса уязвимости (CWE). Отправная точка для правил обнаружения и threat hunting.
Шаблоны атак (CAPEC)
Техники ATT&CK
—
Журнал изменений
Изменений отслеживаемых полей пока нет. Здесь появятся изменения оценки, KEV, зрелости эксплойта и статуса исправления.
Источники
- github.com/samtools/htslib/commit/22ec5230ef95769ab009420da69568c7e530af28
- github.com/samtools/htslib/commit/2a45eb129d703ad27f9fabc8169f0e94d3c69fa3
- github.com/samtools/htslib/commit/4a5ef25eb1fb3d64438103316fffe423b2c3f5f4
- github.com/samtools/htslib/security/advisories/GHSA-5cj8-mj52-8vp3
Рекомендации вендоров и официальные записи. Ссылки на эксплойты/PoC намеренно исключены.